domingo, 29 de marzo de 2020

Covid-19: Plataformas que ofrecen material gratuito por Cuarentena




Estamos en cuarentena. El coronavirus nos puso en jaque como humanidad. En Ecuador, el gobierno optó por medidas radicales para frenar la curva de contagios, por eso decidió poner a la población en cuarentena y con toque de queda desde las 14:00 pm.

Y, que hacemos con todo este tiempo en casa? Maratones de series en Netflix es una opción, pero que tal si aprovechamos estos momentos difíciles. hay varias opciones podemos empezamos a leer, capacitarnos, visitar museos o ver conciertos en vivo. Te presentamos una serie de plataformas que nos permiten aprovechar estos tiempos difíciles para enriquecernos culturalmente y lo mejor es que son gratuitas.

Cursos


Nuestras favoritas, plataformas gratuitas como Coursera o EDX donde puedes tomar cursos MOOCs (curso en línea masivo y abierto) como asistente, lo que te da acceso a todo el material de aprendizaje, y solo sí necesitas pagas por los certificados. Aquí tenemos cursos de casi todas las materias de las mejores universidades del mundo, tanto en inglés como en español, solo debemos encontrar el que nos interese. Si no tienes dinero, pero necesitas el certificado puedes probar con la asistencia económica. También esta Khan academy, donde puedes encontrar cursos de materias como Biología, Química o Física para ayudar a los chicos de colegio.

Crehana: Esta es una plataforma te permite tomar cursos de capacitación creativa. Puedes encontrar cursos de marketing, comunnity manager, liderazgo, pintura, fotografía. Normalmente ofrece cursos en línea pagos, pero por cuarentena abre por 24 horas cursos de muy buena calidad, y si acabas el proyecto final incluso puedes acceder al certificado. Domestika también ofrece cursos gratis de educación para creativos. Puedes ver el catalogo gratuito aquí

La UTPL (Universidad Técnica Particular de Loja) también nos ofrece cursos gratuitos en su open campus. Hay cursos muy buenos de administración, marketing, derecho labora, Biología entre otros. Las inscripciones son hasta el 13 de abril. La EPN (Escuela Politécnica Nacional) nos abre las puertas a sus cursos en línea, con inscripciones gratuitas. Solo si necesitas el certificado debes cancelar un costo económico. 

Libros 


Si los cursos no son lo tuyo, o tienes niños en casa, que no quieres que pasen solo frente al televisor, un libro es la opción. 

Mientras las escuelas estén cerradas, estamos abiertos. Audible, una compañía del gigante Amazon, permitió acceder a una increíble colección de historias, incluidos títulos en seis idiomas diferentes. Solo debes explore la colección, escoger un título y comienza a escuchar.

Si el libro que quieres no esta en Amazon, Apple también tiene lo suyo, sin embargo necesitas poseer un dispositivo de la famosa marca. Ahora si no tienes un iPhone puedes acceder a sitios de dominio público que cuentan con una colección de libros que puedes descargar. Yo lo probé y tiene una buena colección de libros que puedes descargar en pdf sin problemas.

Cultura


Te gustaría algo más cultural: Pues el Museo metropolitano de New York cuenta con una cartelera de conciertos gratuitos, la Filarmónica de Berlín nos ofrece conciertos digitales gratis.

También se puede acceder de forma gratuita a buena parte de las colecciones de museos como el Louvre (Francia), el Museo del Prado (España), el Hermitage (Rusia) o el Metropolitan Museum of Art de New York (EE.UU.).



Estar aislado, no tiene por que ser aburrido

lunes, 16 de diciembre de 2019

El pájaro cuco, es más pícaro de lo que se cree.

Fuente: Audersick, Biología en la Tierra.

En esta especie de aves, la hembra deja sus huevos en el nido de otros padres, e imita sonidos de depredador para distraerlos. Lo que es más sorprendente es el comportamiento innato del pájaro cucú, que poco después de salir del cascarón, este arroja los huevos de sus padres adoptivos del nido, para así eliminar a quienes competirían con él por el alimento

domingo, 8 de diciembre de 2019

5 curiosidades sobre la conferencia de las Naciones Unidas sobre el cambio climático 2019

"Por mucho que nos incomode, el planeta no esta en manos de los científicos, sino de los políticos"-Laura Marcos



Nuevamente los representantes de varios países del todo el mundo se reúnen a hablar sobre el cambio climático.  Esta vez, España es la sede de la "reunión de las partes" COP25 que se lleva a cabo desde el 02 hasta el 18 de diciembre de este mes. Se esta buscando actualizar los compromisos del acuerdo de París de 2015 y entrará en vigor en enero.

5 Curiosidades

1. La conferencia estaba planificada para realizarse en Brasil, pero el gobierno desistió a fines de 2018 aludiendo condiciones económicas
2. Chile asumió la presidencia y la organización del evento, pero se suspendió su realización debido a las protestas ocurridas y se cambió su sede a la capital española
3. Greta Thunberg, la joven activista por el medio ambiente, frente al cambio de sede a Madrid solicitó ayuda a través de twitter para poder llegar
4. Existe una "contra cumbre" donde se busca hablar de los temas tabús que no se hablan en la cumbre oficial que cuenta con la participación de 350 a 400 colectivos ecologistas
5. Estados Unidos, responsable del 13% de las emisiones globales de gases efecto invernadero, no esta presente en esta reunión.

Será que el trabajo de los políticos de turno es suficiente, lograremos alcanzar compromisos para mitigar el cambio climático? Pero sobre todo una vez firmados los compromisos, cada país va a realizar cambios para hacerlos realidad


Fuentes:
La vanguardia, 2019. "COP25.- Indígenas, jóvenes y organizaciones presentes en la COP25, también en la Cumbre Social por el Clima".
Página oficial para la conferencia de las partes COP 25
https://unclimatesummit.org/
CNN en español, 2019. El COP25 es realmente el “punto de no retorno” en la emergencia climática.

miércoles, 1 de mayo de 2019

La terapia genética funciona para curar a los "niños burbuja"



Resultado de imagen para Trastorno de inmunodeficiencia combinada grave ligada al X


FotoPara protegerse de los gérmenes,David Vetter vivió dentro de una cámara de plástico durante 12 años. Murió en 1984 a causa de las complicaciones de un  transplante de médula. Su historia junto con Ted DeVita inspiraron la película de 1976 "El niño en el plástico de burburjas". Crédito: Archivo fotográfico de la Facultad de Medicina de la Universidad Baylor (Tejas, Estados Unidos). 

Investigadores del hospital de St. Jude Children´s Research Hospital de Estados Unidos han usado de forma segura la terapia genética para tratar a ocho niños con el desorden del sistema inmune conocido como la enfermedad de los "niños burbuja", llamada así después de que los pacientes, que crecieron en 1970 tuvieron que encerrarse en una burbuja de plástico para evadir los patógenos. En el estudio, publicado el 18 de abril de 2019 en la revista "The New England Journal of Medicine", los investigadores usaron virus inofensivos para insertar el gen perdido llamado IL2RG en células de la médula ósea tomadas de los infantes con trastorno de inmunodeficiencia combinada grave ligada al cromosoma X (IDCG-X). La primera terapia genética para tratar IDCG-X fue probada dos décadas atrás y pareció exitosa, pero algunos pacientes después desarrollaron leucemia debido a la activación de un gen cancerígeno. Los científicos reportaron que en el nuevo estudio se usó un virus más seguro así como quimioterapia para hacer espacio para las células reparadas, un paso más efectivo para restaurar el sistema inmune de los bebes.

Foto: Peter B.,niño tratado con la terapia génica de St. Jude y su madre. La terapia se basa en el virus de inmunodeficiencia humana, un lentivirus que puede infectar células que no se están dividiendo. Los investigadores han rediseñado el lentivirus para transportar una copia normal de IL2RG a las células madre de la sangre de los pacientes y para que se autoactiven. Crédito: St. Jude Children's Research Hospital / Seth Dixon.

Fuente:
Mamcarz, E., Zhou, S., Lockey, T., Abdelsamed, H., Cross, S. J., Kang, G., ... & Li, C. (2019). Lentiviral gene therapy combined with low-dose busulfan in infants with SCID-X1. New England Journal of Medicine, 380(16), 1525-1534.

jueves, 7 de diciembre de 2017

Sci-Hub en la lucha contra el copyright, dominios caídos? Que podemos hacer?


Sci-hub, la web pirata de papers, estos días ha tenido muchas dificultades en su lucha contra los derechos de autor. Ha perdido la demanda contra la gran editoria Elsevier y también contra la American Chemical Society (ACS). Un juez en Virgina ordeno bloquear a Sci-Hub y sus dominios sci-hub.io, sci-hub-ac y sci-hub.cc se han caido.

Que podemos hacer?, por suerte hace pocas horas han abierto dos nuevos dominios que están funcionando sci-hub.hk y www.sci-hub.tw.

La pirata de la ciencia aun no se rinde, y aunque estos dominios pueden caerse como pasó con la reciente perdida sci-hub.bz, pero siembre se buscara una solución. El objetivo de la plataforma y su creadora Alexandra Elbackyan remover los muros de pago que nos ponen las grandes editoriales para hacer de la ciencia un conocimiento libre, gracias a esta plataforma personas que nos podemos costearnos los artículos de pago, o no tenemos credenciales de nuestras instituciones hemos podido acceder a la información científica.

En lo personal considero que los editores académicos harían mejor en reorientar sus esfuerzos al desarrollo de modelos de negocios para comunicaciones científicas libres, y así serian inmunes a iniciativas como SciHub, además no es justificable que se cobre por un artículo científico donde las grandes editoriales no pusieron dinero y cobraron al investigador para poder publicarlo. En los años 60 y 70 tenía sentido el cobro porque los editores y las revistas gastaban dinero en la producción, pero en la actualidad, en esta era tecnológica los costos de edición bajaron, por lo tanto deberían también reducir los costos para quienes solo buscamos acceso a la información.

martes, 20 de diciembre de 2016

Repasando los hitos científicos del 2016. Número 10: Alargando la vida

Reprogramación celular para revertir el envejecimiento

Una de las noticias más novedosas de la ciencia fue conseguir alargar la vida en ratones con progeria, una enfermedad de carácter genético que provoca el envejecimiento prematuro. El estudio estuvo liderado por científicos del instituto Slak de Estados Unidos  y consiguió aumentar hasta un 30% el tiempo de vida de los ratones, a través de la reprogramación celular.  



INSTITUTO SALK: Izquierda ratón con progeria. Derecha ratón con progeria tratado con reprogramación celular.

"Nuestro objetivo no es lograr que se vivan más años, sino que se viva sano por más tiempo"
 Izpisúa Belmonte

Para el estudio se uso la reprogramación celular en un grupo de cuatro genes conocidos como OSKM, llamados también factores Yamanaka debido al investigador que los descubrió, que permiten a la célula madre adulta convertirse en una célula pluripotente.

Para evitar la formación de tumores se  indujeron los factores Yamanaka durante 2 a 4 días, aplicando la reprogramación parcial en células de la piel de ratones con progeria. El resultado que se obtuvo fue células que rejuvenecieron pero no hasta alcanzar la pluripotencia ni perder su identidad como células de la piel. Los ratones tratados lucían más jóvenes, su función cardiovascular mejoró y vivieron un 30% más que los no tratados sin desarrollar efectos secundarios.

"No hemos corregido la mutación que causa el envejecimiento prematuro en estos ratones. Alteramos el envejecimiento cambiando el epigenoma, lo que sugiere que el envejecimiento es un proceso plástico, que se puede manipular”, comenta Izpisúa Belmonte, autor principal de la investigación.

El experimento aun sigue en marcha en ratones no enfermos porque su tiempo de vida promedio esta entre 2 a 3 años, se cree que es un experimento complejo pero que tiene altas probabiblidades de funcionar, como ya se ha visto en los resultados preliminares.

Fuentes:

Tolosa, A. 2016. La reprogramación celular parcial retrasa el envejecimiento en ratones. Recuperado el 20/12/2016 de: http://revistageneticamedica.com/2016/12/16/reprogramacion-celular-y-envejecimiento/


Ocampo, A., Reddy, P., Martinez-Redondo, P., Platero-Luengo, A., Hatanaka, F., Hishida, T., ... & Araoka, T. (2016). In Vivo Amelioration of Age-Associated Hallmarks by Partial Reprogramming. Cell, 167(7), 1719-1733.

martes, 18 de octubre de 2016

Los meteoritos y cometas podrian habernos brindado los primeros "bloques" de la vida

Figura 1: Un meteorito impactando en la tierra. Fuente: techreport view
Uno de los retos de la Biología es revelar cual es el origen de la vida. Se han originado teorías desde la generación espontánea hasta la hipótesis de Oparin pasando por los experimentos de Miller, sin embargo la ciencia ha seguido buscando la pieza que falta en el rompecabezas: como se dio la transformación de moléculas inorgánicas a orgánicas y que llevó a estas ultimas a constituir a los primeros organismos vivos. Entre las teorías que nos hablan sobre el origen de la vida, la panspermia sigue siendo una de las más populares.

La teoría de la panspermia fue propuesta por Svante Arrhenius a inicios del siglo XX sugiriendo qe la vida había llegado a nuestro planeta en cometas y meteoritos procedentes del espacio exterior, y aunque fue una idea ridiculizada hay pruebas moleculares que han reforzado su popularidad.

Científicos japoneses han realizado un seria de experimentos en el año 2014 para evaluar la posibilidad de que los primeros péptidos llegaran en los cometas, y de acuerdo con sus resultados, el impacto temprano de estos podría haber sido esencial en la síntesis de los primeros "bloques de la vida". Bioquimicamente un péptido es una molécula formada por la unión de varios aminoácidos y es la base para la formación de proteínas.

El experimento que se desarrollo por Sugahara y Mimura de la agencia de la ciencia marina y tecnología así como la universidad de Nagoya respectivamente buscama mimtizar el impacto de los cometas sobre el planeta en la época que aparecieron los primeros microfósiles con vida (hace 4000 años aproximadamente), realizaron mezclas de aminoácidos, hielo y silicatos a temperaturas muy bajas, se modelizo el impacto con una pistola propulsota y se analizaron a continuación los compuestos resultantes.

Se demostró que los aminoácidos eran capaces de unirse den cadenas de tres, formando peptidos que podían resistir temperaturas bajas y probando que en bajas temperaturas los péptidos creados tienen posibilidades de evolucionar hacia cadenas más largas.

Otros estudios que refuerzan la teoría de la panspermia son las investigaciones en el cometa 67P que han comprobado que cuerpos celestes pueden ser una fuente importante de moléculas orgánicas, también se han detectado aminoácidos en el cometa 81P y esto podría dar nuevas pistas sobre el origen de la vida para logar determinar el "salto" de la química a la biología.

El trabajo que se relata demuestra que los aminoácidos presentes en cuerpos helados del exterior pueden llegar a transformarse en péptidos, los bloques esenciales para el origen de la vida

Fuente:

Bernardo, A. 12/08/2015. ¿Cómo nos pudieron brindar los cometas los primeros “bloques” para ensamblar la vida?. Obtenido de: http://goo.gl/5M9p9D

martes, 27 de septiembre de 2016

Sci Hub: El sitio web que permite descargar papers gratis

Hace pocos meses atrás solo buscaba artículos científicos (papers) de acceso libre, porque era frustrante encontrarme con un resumen prometedor, pero no tener dinero para comprar el paper completo, ya que mi institución no tiene acceso a muchas revistas, sin embargo eso ya no es un problema ahora.

Sci Hub se autodenomina como el primer portal del mundo que provee acceso público de forma masiva a trabajos de investigación eliminando las barreras del dinero frente al conocimiento. En sus servidores hasta febrero de 2016 contaba con 50 millones de papers y esos números siguen subiendo ya que al no existir el paper Sci Hub lo piratea. Muchos de los artículos científicos de forma legal costarían entre 30 a 50 dólares dependiendo del artículo científico y la revista.

Figura 1: Costo de un artículo científico de la editorial Elsevier. Fuente: www.ScienceDirect.com

Alexandra Elbakyan es la fundadora de Sci Hub y gracias a ella millones de estudiantes y profesionales cuyas carreras están basadas en la investigación pueden acceder a la información que necesitan, pese a no tener vínculos con grandes universidades o haber pagado por una membresía a las editoriales científicas. Alexandra nació en Arzeibajan y desde pequeña mostró talento en el campo de la informática, estudió el pregrado en su país y luego de regresar de una estancia de investigación en Estados Unidos en el 2011 quiso reanudar su trabajo, pero se topo con un muro conocido como dinero, que no le permitía acceder a los artículos que necesitaba y ahí en medio de su frustración nace la idea de Sci Hub que junto con otros amigos empezó como un pequeño sitio web en 2011.

En la actualidad Sci Hub cuenta con números asombrosos ya que cada día se descargan alrededor de 200 mil papers de todos los continentes del mundo, no tiene fines de lucro, pero acepta donaciones para seguir en la lucha de poder tener un conocimiento sin barreras, al alcance de todos, pese a que tener demandas en Estados Unidos por piratería sus servidores radicados en Rusia constantemente cambian de dominio para seguir en la web beneficiando no solo a personas que viven en países en vías de desarrollo, sino también a científicos en países de primer mundo, los papers desde el portal son descargados desde todas partes porque son simples los pasos a seguir: basta con tener el título o el DOI y pegarlo en el portal pero sobre todo no tienen costo.


Figura 2: Mapa mundial que muestra el porcentaje de descarga de papers desde Sci Hub en una hora. Fuente: http://www.sciencemag.org/news/2016/04/whos-downloading-pirated-papers-everyone

Sci Hub llegó y no se ira, este es un golpe para las editoriales de las cuales Elsevier es la más afectada pero Alexandra pese a los problemas legales sigue defendiendo su idea: "No se debe comercializar con el conocimiento" y piensa que los muros de pago de las editoriales de revistas violan uno de los derechos humanos más importantes: "Toda persona tiene derecho a tomar parte libremente en la vida cultural de la comunidad, a gozar de las artes y a participar en el progreso científico y en los beneficios que de él resulten" (artículo 27 de la Declaración Universal de los Derechos Humanos de la ONU).  

Fuentes:
Bohannon, J. 04/2016. Who's downloading pirated papers? Everyone. Versión on line: http://www.sciencemag.org/news/2016/04/whos-downloading-pirated-papers-everyone
Castro, D. 03/05/2016. Gracias a Sci-Hub dejamos de mendigar papers. Versión en línea: http://elcomercio.pe/blog/expresiongenetica/2016/05/gracias-a-sci-hub-dejamos-de-mendigar-papers
Fernández, E. 09/2015. Sci-hub: una página para descargarse artículos científicos de pago. Versión online: http://bacteriasactuaciencia.blogspot.com/2015/09/sci-hub-una-pagina-para-descargarse.html

miércoles, 31 de agosto de 2016

Un gato co-autor de un importante paper de Física


Esta imagen es una dramatización 
[Foto: http://misanimales.com/wp-content/uploads/2015/05/gato-siames.jpg]

Hay muchos gatos famosos por diversos motivos como aparecer en memes, películas o videos pero pocos por escribir un artículo científico, sin duda el caso de Chester Willard es único en el mundo de las Ciencias, pero, ¿ Cómo pudo escribir un gato el paper? A continuación la historia.

En 1975 el físico y matemático Jack H. Hetherigton que trabajaba como profesor en la Universidad de Michigan escribió un artículo relativo a sus investigaciones sobre el helio. Antes de enviarlo un amigo suyo lo revisó encontrado errores en la redacción ya que estaba redactado en plural cuando solo constaba un autor. En ese tiempo se redactaba en maquina de escribir por lo que el corregir ese error implicaría una  nueva redacción del paper y encontrar un segundo autor que se prestase a firmar el artículo ya escrito, sin modificar el contenido también era complicado, entonces Hetherington decidió inventarse el nombre del físico que firmaría como co-autor: F.D.C Willard.

Sin embargo el autor existía realmente, era su gato Chester, como algunos de sus amigos lo conocían oculto su nombre con las iniciales F.D provenientes  de Felis Domesticus y C de Chester y usó Willard como apellido (nombre del padre de Chester). A finales de 1975 la revista Physical Review Letters publicó el artículo  “Two, Three and Four Atom Exchange Effects in bcc^3 He”  firmado por Hetherington y Willard. Como tuvieron cierto éxito en 1980 la revista francesa publicó el artículo 
“L’hélium 3 solide: un antiferromagnétique nucléaire” que firmado únicamente por Willard.

Imagen del encabezado del paper con las firmas de Hetherington y su gato Chester co-autor del artículo científico.[Fuente: http://79.170.40.244/academiaobscura.com/wp-content/uploads/2014/07/Willard-paper-e1406630466484.jpg]


Una periodista fue hasta la Universidad de Michigan para hacer una entrevista a los famosos profesores por lo que Hetherington tuvo que revelar su historia y presentó a su gato F.D.C. Willard 


Fuente: 
Formación Universitaria. 2015. Gatos Famosos en las Ciencias. Vol. 8 no. 6 La Serena. http://dx.doi.org/10.4067/S0718-50062015000600001 


Virus del Dengue (DENV)

El virus del dengue (DENV) es un arbovirus ("arbo" acrónimo del inglés arthropod-borne, transportado por artrópodos) y pertenece al género de Flavivirus familia Flaviviridae, un grupo de más de 68 agentes virales agrupados por su relación serológica y por la determinación de secuencias genómicas, al menos 30 de estos virus causan enfermedad en los humanos (Velandia & Castellanos, 2011).

La familia Flaviviridae agrupa virus ARN de cadena simple en sentido positivo que se multiplican en células de vertebrados y de insectos vectores. Este virus forma parte del cuarto grupo de la clasificación propuesta por Baltimore. El grupo del virus del Dengue está representado por 4 serotipos (o subespecies): Virus Dengue 1, Virus Dengue 2, Virus Dengue 3 y Virus Dengue 4, todos los cuales generan la enfermedad conocida como dengue (Bhatt, et al, 2013).


Estructura


La envoltura es ligeramente esférica, la nucleocápside es icosaédrica y contiene al virión. La partícula viral del dengue mide entre 40 y 60 nm de diámetro. La superficie viral es inusualmente lisa y la membrana está completamente cubierta por la proteína E (Hoyos & Pérez, 2010).

Este genoma está compuesto por una sola molécula de ácido ribonucleico (RNA) de cadena sencilla lineal, de sentido positivo, de 9 500 a 12 500 nucleótidos y de alta variabilidad genómica, con un único marco de lectura que traduce un polipéptido completo. El genoma da lugar a 3 proteínas estructurales: la proteína E de envoltura, glicoproteína que cumple un papel importante durante la penetración del virus en la célula y en la respuesta inmunitaria, prM de membrana y la proteína C de cápside y a 7 proteínas no estructurales (NS1, NS2a, NS2b, NS3, NS4a, NS4b y NS5) (Velandia & Castellanos, 2011).

Se ha descrito una homología de secuencia de aproximadamente 70 % entre los diferentes serotipos de dengue, siendo dicha homología mayor entre los serotipos 1, 2, y 3  (Hoyos & Pérez, 2010).





Fig 1. (A) Estructura de la partícula de DENV. (B) Estructura del genoma de DENV. Fuente: Velandia & Castellanos, 2011.

Ciclo viral intracelular

Fuente: Velandia & Castellanos, 2011

Entrada, fusión y desnudación de la partícula

La entrada del virus en las células de los mamíferos así como en el mosquito se inicia con el acercamiento del DENV a la superficie de la célula donde la proteína E interactúa con los proteoglucanos de la membrana celular especificamente con el receptor par laminia LAMR1, la proteina ICAM-3 (Dendritic Cell-Specific Intercellular Adhesion Molecula 3-Grabbing Non-integrin) y el heparán sulfato, entre otros (Lei, et al, 2001; Velandia & Castellanos, 2011). Después de la interacción ocurre una endocitosis mediada por clatrinas. La vesícula endocítica se transforma en un endosoma y se fusiona con un lisosoma, se acidifica el pH y se induce la liberación de la nucleocápside en el citoplasma (Hoyos & Pérez, 2010)


Replicación del ARN viral

Cuando la nucleocápside se halla libre en el citoplasma, se inician los procesos de traducción y replicación del ARN. El ARN genómico viral del DENV es monocatenario, de sentido positivo, y es procesado en el retículo endoplásmico por proteasas celulares y la actividad NS3pro, que libera de forma ordenada a las tres proteínas estructurales (C, prM/M y E) y las siete proteínas no estructurales (NS1, NS2A, NS2B. NS3, NS4A, NS4B, NS5) encargadas de la replicación del genoma y el ensamblaje viral (Kyle & Harris, 2008).

Durante la traducción, el polipéptido recién sintetizado es acompañado por las proteínas chaperonas BiP, calnexina y calreticulina; luego, cada una de las proteínas virales se organiza en la membrana del retículo endoplásmico y es procesada por proteasas como la furina, la signalasa o la NS3Pro, para finalmente ser modificadas después de la transducción (plegamiento y glucosilación) (Hoyos & Pérez, 2010).


Ensamblaje, maduración y liberación del DENV

El proceso de ensamblaje de las partículas del DENV ocurre por la interacción del ARN genómico y la proteína C, y se lleva a cabo en distensiones del retículo endoplásmico denominadas membranas “convolutas” (convolute), donde ocurre de forma simultánea la traducción de la proteína y el ensamblaje del virus (Velandia, & Castellanos, 2011).

La primera parte de la maduración es cuando la superficie de la partícula adquiere un aspecto rugoso. En el segundo paso, esta partícula inmadura transita desde el retículo endoplásmico hasta el aparato de Golgi, donde se dan cambios conformacionales y rotacionales de la proteína E, volviendo lisa a la partícula (Lei, et al., 2001).

Finalmente, cuando el virus es liberado se escinde el péptido pr y la proteína E adquiere la conformación final que puede ser reconocida por las moléculas receptoras. El virus es liberado por exocitosis, y adquiere su membrana a partir de la célula hospedera (Hoyos & Pérez, 2010).

Expresión


Proteínas estructurales

Proteína C: proteína de la cápside, también conocida como proteína core o de cubierta.
Proteína precursora de membrana (prM) y proteína de membrana (M): proteína precursora de membrana (prM), presente en los viriones inmaduros y junto con la proteína M, participa en el proceso de maduración de la partícula viral. 
Proteína de envoltura E: se distribuye sobre la superficie del virus y es determinante para las interacciones entre el virus y los receptores de las células vulnerables. Por otra parte, la glucoproteína E es el principal inmunógeno del virus, es decir, estimula la respuesta inmune del individuo e induce la producción de anticuerpos neutralizadores.

Proteínas no estructurales 

NS1: puede estimular al sistema inmunitario.
NS2A: promueve el ensamblaje y la replicación viral, decide si el ARN genómico producido en cada ciclo de replicación se utiliza como nueva plantilla para generar las formas replicativas o si se asocia dentro de la nucleocápside.
NS2B: interactúa con el dominio proteasa de la proteína NS3 para actuar como su cofactor.
NS3: actúa como trifosfatasa de nucleótidos estimulada por ARN (NTPase) y como helicasa del ARN (NS3Hel), siendo indispensable en la replicación viral. 
Sobre las proteínas NS4A y NS4B no se conoce su función específica, pero se sabe que están involucradas en la replicación del virus.
NS5: es la más conservada entre todos los flavivirus, posee actividad enzimática de metiltransferasa y guanidiltransferasa, responsables del capping y la metilación del extremo 5´ del ARN genómico. Por lo tanto, la proteína NS5 actúa como la única polimerasa durante la replicación y transcripción virales (Hoyos & Pérez, 2010; Velandia, & Castellanos, 2011).

Sintomatología


La morbilidad y mortalidad causadas por la infección por DENV, están dadas por la complejidad de eventos que se presentan en el transcurso de la infección, pues pueden ocurrir cuadros febriles y dolores generalizados que se resuelven rápidamente sin dejar secuelas. A este tipo de manifestación clínica se le conoce como dengue (fiebre de dengue). Otros pacientes, por el contrario, presentan dolores intensos, fiebre alta e incrementos en la permeabilidad vascular, lo que conlleva a la pérdida de plasma y hemorragias pleurales y gastrointestinales, entre otros. Estos signos son agrupados en dos entidades clínicas conocidas como dengue con signos de alarma y dengue grave con manifestaciones hemorrágicas o sin ellas, llamado dengue hemorrágico (Bhatt, et al., 2013).

Las principales células diana de la infección por DENV son los monocitos, los macrófagos, las células dendríticas y los linfocitos CD4+ y CD8+. Infectan células del endotelio, varias líneas celulares hepáticas, fibroblásticas y neuronales (Lei, et al., 2001). 

Se presenta una respuesta inmunitaria normal (secreción de IFN, producción de células NK y linfocitos T) en los pacientes infectados por primera vez; sin embargo, en los pacientes que sufren una nueva infección con un serotipo diferente al que causó la primera o el mismo serotipo, presentan mayor probabilidad de desarrollar dengue grave. Esto se explicaría por la constante estimulación que con lleva a la activación celular, y el aumento de la expresión de mediadores y de receptores que resulta patológico (Bhatt, et al., 2013).

Prevención y/o terapia


En los últimos años, a partir del conocimiento de la estructura del virus, se ha propuesto, por ejemplo, el bloqueo de la actividad NS3pro con inhibidores específicos, el bloqueo de la polimerasa NS5 con nucleótidos modificados y, más recientemente, se está usando la detección de la proteína NS1 en el suero, como una prueba diagnóstica de mayor sensibilidad. Sin embargo, hasta ahora no hay antivirales para el dengue, por lo cual el tratamiento se dirige a aliviar los síntomas clínicos (Brady, et al., 2012; Bhatt, et al., 2013).

A principios de 2016 se aprobó en varios países el uso de la primera vacuna preventiva contra el dengue, llamada Dengvaxia (CYD-TDV), de Sanofi Pasteur. Esta es una vacuna de virus vivos atenuados y recombinantes, que estimula la fabricación de proteínas inmunogénicas. Protege contra los virus del dengue 1, 2, 3 y 4, con una eficacia del 60% (Bhatt, et al., 2013). 

Se están elaborando otras tres vacunas vivas atenuadas tetravalentes, y hay otras vacunas basadas en ADN y virus inactivado purificado. Por ejemplo, CYD-TDV es una tetravalente vivo atenuado que se hizo usando tecnología de ADN recombinante mediante la sustitución de prM (pre-membrana) y E (envoltura) y DEN-Vax, que es una vacuna recombinante con componentes de DENV1, DENV3, y DENV4 en un esqueleto de virus del dengue 2 (DENV2) (Tolle, 2009; Brady, et al., 2012).
Un método para controlar o prevenir la transmisión del virus del dengue consiste en evitar los vectores, impidiendo que los mosquitos encuentren lugares donde depositar sus huevecillos mediante la asepsia del medio y la limpieza del agua para uso doméstico (Kyle & Harris, 2008).



Bibliografía

Trabajo editado de Virus del Dengue realizado por Nathaly Haro, Universidad de las Fuerzas Armadas-ESPE.
  1. Bhatt, S., Gething, P. W., Brady, O. J., Messina, J. P., Farlow, A. W., Moyes, C. L., & Myers, M. F. (2013). The global distribution and burden of dengue.Nature, 496(7446), 504-507.
  2. Brady, O. J., Gething, P. W., Bhatt, S., Messina, J. P., Brownstein, J. S., Hoen, A. G.,  & Hay, S. I. (2012). Refining the global spatial limits of dengue virus transmission by evidence-based       consensus. PLoS Negl Trop Dis, 6(8), e1760. 
  3. Hoyos, A., & Pérez, A. (2010). Actualización en aspectos epidemiológicos y clínicos del dengue. Revista Cubana de Salud Pública,36(1), 149-164.
  4. Kyle, J., & Harris, E. (2008) Global spread and persistence of dengue. Annual Rev Microbiol.;62:71- 92.
  5. Lei, H., Yeh, T., Liu, H., Lin, Y., Chen, S., & Liu, C. (2001) Immunopathogenesis of dengue virus infection. J Biomed Sci.;8:377-88.
  6. McBride, W., & Bielefeldt, H. (2000) Dengue viral infections; pathogenesis and epidemiology. Microb Infect.;2:1041-50.  
  7. Tolle, M. (2009) Mosquito-borne diseases. Curr Probl Pediatr Adolesc Health Care.;39:97-140.
  8. Velandia, M. L., & Castellanos, J. E. (2011). Virus del dengue: estructura y ciclo viral. Infectio, 15(1), 33-43.







viernes, 26 de agosto de 2016

Bioquímica, Wener Müller-Esterl

Bioquímica
Fundamentos para Medicina y Ciencias de la Vida
Werner Müller-Esterl, 2008
Editorial Reverté


Otro libro a la lista muy recomendado que busca ordenar los principios y conceptos básicos de la bioquímica para darles una estructura clara que muestre  y guíe en los temas importantes para todo estudiante de Ciencia de la Vida.


domingo, 21 de agosto de 2016

Biología: Helena Curtis

Imagen tomada del sitio de la editorial medica panamericana.
Sin duda uno de los mejores libros de Biología para poder entender el fantástico  mundo de los seres vivos desde los átomos y moléculas que son abarcados en el capítulo uno, pasando por animales, plantas y por supuesto el ser humano. Presenta un amplio panorama del mundo biológico de manera fácil y amena siendo un punto de consulta en áreas de la salud y ciencias naturales por lo que no debe faltar en la biblioteca ya sea física o digital de todo estudiante relacionado a la ciencia de la vida.

viernes, 19 de agosto de 2016

Rotavirus

Los rotavirus (RVs) son miembros de la familia Reoviridae, causando una enfermedad diarreica grave en muchas especies de mamíferos, aves y el ser humano [1]. Es el principal agente causal de la gastroenteritis aguda (GA) con deshidratación en niños a nivel mundial, la organización mundial de la salud (OMS) sostiene que es el responsable de aproximadamente el 40% de las hospitalizaciones y de medio millón de muertes en niños menores de 5 años [2]. Se han identificado hasta el 2014 8 subtipos denominados desde la A hasta la H, sin embargo solo los grupos A, B, y C infectan a los seres humanos, siendo el grupo A el más común [3]. Su nombre se debe a que su forma semeja a la de una rueda de carreta [4].

1.      Estructura y morfología
Es un virus icosaédrico sin envoltura de 70 nm de diámetro. Presenta una cápside proteica  de tres capas estructurales: una cápside interna y una externa además de una estructura proteica central (core) que rodea a su genoma de 11 fragmentos de RNA de doble cadena. El genoma codifica para 6 proteínas estructurales (VP1-VP4, VP6 y VP7) y 6 proteínas no estructurales (NSP1- NSP6). 
Las variaciones antigénicas de la capa media (VP6) han dado lugar a la clasificación de los rotavirus en 8 grupos [4] y las proteínas VP4 y VP7 definen la clasificación vinaria de los rotavirus del grupo A en 10 serotipos G y 7 genotipos P. El tamaño de su genoma varia de aproximadamente 660 pb del gen más pequeño, hasta 3300 pb para del gen más grande [5].



2.      Replicación viral y expresión
El ciclo de la replicación viral comienza con la unión del virión a la superficie de la célula mediada por receptores y su internalización por endocitosis. No se ha descrito claramente un receptor para el Rotavirus, sin embargo estudios proponen un mecanismo rotaviral de unión y entrada a célula de múltiples pasos donde las proteinas retrovirales VP4 y VP7 interaccionan con diferentes moléculas de la superficie celular donde la participación de la proteína disulfuro isomerasa (PDI) se propone como mecanismo [6] así como N-glicoproteínas [7].
Una vez que el rotavirus penetra al interior de la célula pierden su capa de proteína exterior, con lo cual se activa la transcripción que depende de la RNA polimerasa viral (VP1). Se da lugar a 11 transcriptos de ARN que codifican 12 proteínas virales así los ARNs recién sintetizados cumplen dos funciones mensajeros que dirigen la traducción y como moldes para la síntesis de los ARNs complementarios. La selección, el empaquetamiento, y la replicación de los segmentos del genoma, así como la morfogénesis de las partículas de doble capa (DLPs), se llevan a cabo en estructuras electrodensas denominadas viroplasmas, que están compuestos de grandes cantidades de ARN y proteínas virales [8].
Una vez formadas, las DLPs abandonan el viroplasma, se dirigen al lumen retículo endoplásmico ruguso donde se completa la maduración de la partícula viral. Los viriones maduros son liberados de la célula por lisis. Todo el ciclo replicativo de los rotavirus se lleva a cabo en el citoplasma celular, sin necesitar el núcleo de la célula (Figura 1) [6].



Figura 1: Ciclo de replicación de Rotavirus. (López, 2016)

3.      Infección viral
Los rotavirus tienen distribución mundial, la prevalencia más alta se presenta en los meses fríos, aunque en las regiones con poca variación de temperatura no hay una distribución estacional clara. La infección por rotavirus ocasiona diarrea severa en la población infantil siendo un problema de salud pública, particularmente en ciudades en desarrollo ya que la principal vía de transmisión del virus es la fecal-oral [4].
Las enfermedades intestinales ocupan los primeros lugares entre las veinte principales causas de mortalidad en menores. El mayor porcentaje de las defunciones ocasionadas por esta enfermedad se debe a deshidratación. En el Ecuador un estudio ejecutado en los principales hospitales pediátricos reveló que en niños menores de 5 años, 41 de cada 100 casos padecen diarreas por el virus [2].

4.      Cuadro clínico.
El periodo de incubación oscila entre 1 - 3 días. El espectro clínico de la infección por rotavirus presenta límites amplios: puede cursar de manera asintomática, dar lugar a una diarrea acuosa con duración limitada hasta una diarrea severa con vómito, fiebre y deshidratación [6].
La severidad de las manifestaciones clínicas depende del serotipo o subtipo, la edad y condiciones previas de salud. El vómito es un signo importante y muy frecuente. Puede presentarse antes que la diarrea; ésta es de tipo acuoso y se asocia a deshidratación, que puede ser muy severa. Otros signos y síntomas: fiebre de corta duración, mialgias, cefalea y en ocasiones, datos respiratorios [6].

5.      Diagnóstico.
Existen diversos métodos que se pueden emplear para realizar el diagnóstico de rotavirus y, como en otros procedimientos de laboratorio, la técnica de elección dependerá del equipo y reactivos de que se disponga en el mismo. 
A pesar de que el diagnóstico es principalmente clínico, las características del cuadro causado por rotavirus son inespecíficas, por lo tanto la confirmación de la infección es mediante el diagnóstico etiológico en el laboratorio a partir de muestras fecales. Uno de los métodos disponibles en el mercado para el diagnóstico de rotavirus es la detección de antígeno viral específico común a todos los rotavirus del grupo A por inmunoensayo (ELISA) [8]. 
Comercialmente hay disponibles diversos estuches (kits) comerciales. Entre ellos se encuentran los estuches de detección rápida del antígeno del rotavirus en las heces [8].
Las cepas se caracterizan mediante pruebas inmunológicas enzimáticas o reto transcripción acoplada a la reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR), hibridación de ácidos nucleicos y cultivo celular, utilizadas en el campo de la investigación [8].


Tratamiento y prevención

Se basa en rehidratación oral y otras medidas de sostén, no siendo necesario el uso de antibióticos una vez confirmado el origen viral de la diarrea.
En el 2006, dos vacunas contra el rotavirus mostraron ser seguras y efectivas en los niños: Rotarix desarrollada por los laboratorios GlaxoSmithKline y es creada a base de virus vivos atenuados y RotaTeq desarrollada por los laboratorios Merck y es creada con virus recombinantes humanos y bovinos. Ambas se administran vía oral y contienen virus vivos atenuados [6].
En 2006, la FDA aprobó RotaTeq para su uso en los Estados Unidos y anunció un precio de 187.50 para el régimen estándar de tres dosis. Por tanto, es una de las inmunizaciones infantiles más costosas, a pesar de los descuentos viene a ser una opción inalcanzable para los infantes del tercer mundo. Sin embargo la OMS recomienda fuertemente la inclusión de la vacuna contra rotavirus a los programas de inmunización en todas las regiones del mundo [2].

Trabajos Citados
1.      Ramig R, Ciarlet M, Mertens P, Dermody T. Rotavirus. Virus Taxonomy: Eight Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam, Holland: Elsevier, Academic Press; 2005. p. 484-96.
2.      Organización Mundial de la Salus (OMS). Introducción de vacuna contra el rotavirus; 2008. Obtenido de: http://www.paho.org/ecu/index.php?option=com_content&view=article&id=81:introduccion-vacuna-contra-rotavirus&Itemid=292.
3.      Jelle, M; Reimar, J; Ulrich, D. Create 3 new rotavirus species (Rotavirus F, Rotavirus G and Rotavirus H) in the existing genus Rotavirus. International Committee on Taxonomy of Viruses; 2014. Obtenido de: http://www.ictvonline.org/proposals/2014.002aV.A.v2.Rotavirus_3sp.pdf
4.      García, H; Uribaren, T. Rotavirus, norovirus, adenovirus y otros virus en tracto digestivo. Departamento de Microbiología y Parasitología, Facultad de Medicina, UNAM; 2011.
5.      Both, G. W., A. R. Bellamy, and D. B. Mitchell 1994. Rotavirus protein structure and function Curr Top Microbiol Immunol. 185:67-105.
6.      Acosta O, Calderón MN, Moreno LP, Guerrero CA. Un modelo del mecanismo de entrada de los rotavirus a la célula hospedera. Rev.Fac.Med. 2009; 57: 124-148.
7.      Guerrero CA, Zárate S, Corkidi G, López S, Arias CF. Biochemical Characterization of Rotavirus Receptors in MA104 Cells. Journal of Virology. 2000;74(20):9362-9371.
8.      López, S; Sánchez-Tacuba, L; Moreno, J; Arias, C. Rotavirus: Strategies Against the Innate Antiviral System. Annual Review of Virology, Vol. 3: (Volume publication date November 2016). Doi:10.1146/annurev-virology-110615-042152.

Dinámica de las cuasiespecies de virus de RNA




Muchos de los virus de RNA son patógenos de los seres humanos, animales y plantas. Este tipo de virus evoluciona rápidamente, lo que produce alta variabilidad genética, pero dificulta su control en las enfermedades, ya que las mutaciones les confieren una ventaja a las defensas de los hospedadores, antivirales y vacunas; además le permiten adaptarse a los cambios ambientales y ecológicos, por esa razón reemergen las infecciones virales. Los virus de RNA son una herramienta usada en virología para explorar la población genética y los conceptos de biología, debido a las altas tasas de mutación, el rápido tiempo de generación, y su genoma corto.

El termino cuasiespecie lo adoptaron Eigen y Schuster el explicar que la entidad autoreproductora no es una sola molécula, sino un "enjambre" o "nube" de varias moléculas reproductoras con una distribución numérica gobernada por una ecuación.  Estos grupos llamados cuasiespecies, han sido descriptos a través de análisis moleculares y biológicos. El primer análisis se realizó en un bacteriófago QB. Actualmente cuasiespecie hace referencia a las distribuciones de genomas no idénticos, pero cercanamente relacionados que están sometidos a un proceso continuo de variación genética, competencia y selección. Por lo tanto la capacidad de evolución de los genomas virales individuales es influenciada por el espectro de mutantes que los rodea.

Al contrario de la DNA polimerasa, los virus de RNA carecen de actividad correctora, causando la modificación de los genomas virales adquiriendo diversidad frente a respuestas del sistema inmune o terapias antivirales. Se predicen que hay un valor límite de error o taza de mutación denominada el umbral de error, el cual no debe superarse para que pueda mantenerse la información genética del virus. Las tasas de mutación de los virus de ARN están cerca del umbral de error, lo que es un rasgo de adaptación, pero produce la desventaja de que no son capaces de tolerar mutaciones adicionales sin una pérdida de viabilidad. La nueva forma de luchar contra los virus, no es inhibiendo su replicación, sino aumentando la tasa de mutación.

La recombinación y reordenamiento de RNA también están implicados en la generación de nubes mutantes. La recombinación ocurre en todos los virus de ARN (genoma formado por uno o múltiples segmentos). El modelo más aceptado se denomina recombinación “copy choice”, en el cual la ARN polimerasa (o retrotranscriptasa), cambian una molécula de ARN con otra durante la síntesis del ARN mientras permanece unido a la cadena madre, generando un ARN con ascendencia mixta. El reordenamiento se limita a los virus que poseen genomas segmentados.

La recombinación y reordenamiento se producen a frecuencias variables, por ejemplo la recombinación es más frecuente en ARN mc (+) que (-), y más en algunos retrovirus que otros. El VIH-1 tiene una taza de mutación de 1.38×10−4 que es más alta comparada con 4×10 −8 del HCV. La capacidad de recombinación del VIH-1 reside en que las cuasiespecies resistentes a múltiples fármacos que están en las células pueden ser rescatadas por recombinación debido a una superinfección con otras variantes defectuosas de VIH-1.


Cuasiespecies, enfermedades virales y patogénesis

Caracterizar la virulencia de los virus permite elaborar estrategias de control de enfermedades. Las virulencias, originalmente solo se atribuía  a los cambios de nucleótidos en regiones específicas del genoma, ahora se considera otros factores como por ejemplo la fidelidad de la polimerasa, ya que mientras más errores cometa en la replicación, producirá más diversidad genómica. También se considera la complementación entre los miembros de las cuasiespecies que le dan a la población viral una gran capacidad para evolucionar y adaptarse a las nuevas condiciones y cambios durante la infección.

Los virus de ARN mutantes con alta fidelidad de la polimerasa, junto con otras mutaciones atenuantes podrían ser útiles para el desarrollo de vacunas de virus vivos genéticamente estables. Además, la patogénesis viral también podría ser modulada por la proporción de genomas atenuados y virulentos, y sus interacciones.

La diversidad genética viral es importante para la supervivencia de la población viral ya que las presiones selectivas favorecen las mutaciones que producen fenotipos beneficiosos, que se espera que puedan para sobrevivir y actuar como fundadores para la próxima generación, pero esto no solo se debe a la respuesta del sistema inmune. Existe altas tasas de mutación en los virus de ARN que infectan bacterias, lo que sugiere que esta adaptación  no es atribuida a un punto específico historia de la vida.


Cuasiespecies y tratamiento del virus

Una de las consecuencias de las cuasiespecies virales, es su impacto en las terapias antivirales. La capacidad de adaptación de los virus de ARN se basa en su alta frecuencia de virus mutantes con una o unas pocas sustituciones de aminoácidos que le confieren reducción de sensibilidad a los antivirales, dificultando el desarrollo de tratamientos contra enfermedades causadas específicamente por este tipo de virus.

El mejor ejemplo de la selección adaptativa, son los virus mutantes de VIH-1 que son resistentes a los inhibidores retrovirales. Todas las clases de terapia antiretroviral ejercen una presión selectiva para las mutaciones del gen diana que confiere resistencia a los medicamentos de alto nivel. Se ha demostrado la existencia de múltiples especies mutantes resistentes  antes que los haya expuesto a los inhibidores.

Las casiespecies virales están dotadas de memoria de su pasado dentro de la historia de la evolución como variantes minoritarias que pueden reaparecer si se someten a presiones selectivas pudiéndose así expandirse rápidamente, por ejemplo los fármacos. Los virus de ARN pueden llegar a escapar de la actividad antiviral a través de mutaciones en el gen viral objetivo de los fármacos lo que produce disminución de afinidad con el inhibidor y eso lleva a la resistencia. Un ejemplo de la  resistencia de los virus de RNA es la gripe H1N1 (2009) donde se ha detectado que en casos esporádicos el virus tiene una sustitución de un aminoácido (H274Y) que le confiere resistencia a su fármaco antiviral (oseltaivir).

La aparición de variantes de virus resistentes plantea un problema médico grave. En consecuencia, diferentes estrategias han sido desarrolladas para contrarrestar escape viral. la experiencia con la terapia antirretroviral contra el VIH ha enseñado que no es realista tratar de apuntar a los virus de ARN con un solo agente antiviral debido a que el virus va a desarrollar rápidamente resistencia. El tamaño grande de las poblaciones, altas tasas de replicación y de errores de los virus de RNA proporcionan la base para la mutación y el rápido crecimiento de variantes que pueden escapar de la terapia antiviral antes de que comience el tratamiento.

Para contrarrestar esta situación, las terapias antivirales ahora implican la coadministración de múltiples fármacos dirigidos a diferentes proteínas virales a una sola proteína viral  a través de diferentes mecanismos de acción. Esta estrategia puede reducir la aparición de un solo virus resistente, por ejemplo como sucede con  la combinación de múltiples fármacos  anti-VIH  un enfoque, conocido como terapia antirretroviral de gran actividad (HAART). El éxito clínico de la terapia HAART garantiza el uso de una estrategia similar para contrarrestar el escape viral durante el tratamiento de otras infecciones de virus de ARN.

lunes, 20 de junio de 2016

Virus como indicadores de contaminación de agua y alimentos





Resumen de la conferencia dictada el día 20 de junio de 2016 en el XI congreso de Ciencia y Tecnología en la Universidad de las Fuerzas Armadas - ESPE, Sangolqui-Ecuador por Ayalkibet Hundesa, veterinario y doctor en Microbiología y Biotecnología, investigador de la Universidad de Barcelona.

En el año 2012 según la organización mundial de la salud 12.6 millones de personas han contraído enfermedades por vivir en ambientes poco saludables (OMS, 2016), debido a la contaminación de agua, alimentos, aire y exposición a productos químicos que contribuyen a mas de 100 enfermedades e importantes pérdidas económicas.

El medio acuático puede verse contaminado sobre todo por heces fecales producidas por el hombre el cual descarga de 80 a 270 gramos al día por persona lo que representa aproximadamente 10^11 gramos al año a fuentes como el océano, ríos y lagos, agua subterránea, agua de regadío que contaminan a mariscos, espacios recreativos para nadar, agua de bebida, y vegetales respectivamente.

El agua de bebida es uno de los recursos que más control sanitario tiene. Para poder analizarla se suelen utilizar indicadores como bacterias y virus  y así establecer la calidad del recurso. Algunos ejemplos son:

E.coli: puede sobrevivir 30 días en el suelo
Salmonella spp: puede permanecer en el suelo 72 semanas o 10 días en un jugo de manzana
● Enterovirus: pueden sobrevivir en el suelo por más de 5 meses .

Las bacterias son muy usadas en la actualidad como indicadores de calidad debido a que se tiene un conocimiento amplio sobre las mismas en especial del grupo de Enterobacterias que causan enfermedades gastrointestinales, sin embargo las baterías presentan algunas desventajas como:
● Sensibilidad a la inactivación por el medio ambiente.
● Capacidad de multiplicarse en el medio.
● Incapacidad de detectar la fuente se contaminación.

Por estas causas y gracias al desarrollo de herramientas moleculares se ha empezado a usar los virus como indicadores de control de calidad ya que al necesitar el material de la célula para replicarse no se pueden  multiplicar en el medio, por lo tanto se puede identificar la fuente de contaminación  sobre todo si provienen de heces fecales al usar virus exclusivos de seres humanos.

Entre los virus que más se usan como indicadores están los de RNA que causan las enfermedades de Hepatitis A, Hepatitis E, entre otros y los virus de DNA  como adenovirus y polyomavirus. 

Para poder detectar los virus se usan herramientas moleculares como la rección de cadena de la polimerasa (PCR), PCR en tiempo real (qPCR), metagenómica. nested PCR, entre otras. Los pasos que deben usarse son:

  1. Concentrar el virus del medio.
  2. Extraer el ADN o ARN
  3. Amplificar el segmento genómico de interés.
  4. Detección o cuatificación del segmento genómico amplificado.

Estos indicadores permiten determinar la calidad del agua en cualquier parte del mundo ya que se ha demostrado que aunque un país sea altamente industrializado existe un alta tasa de prevalencia de virus en el medio ambiente.

Para prevenir las enfermedades causadas por virus se debe mantener programas de vigilancia que permitan valorar parámetros víricos, además se deben practicar normas de higiene y aseo al tratar con alimentos.

Con perspectivas a futuro se debe buscar estandarizar técnicas para la detección de virus ya que presentan varias ventajas frente a las bacterias a la hora de actuar como indicadores de contaminación ambiental.

Trabajos citados

Organización Mundial de la Salud. 2016. Cada año muren 12.6 millones de personas a causa de la insalubridad del medio ambiente. Boletín de prensa. Ginebra.

Bofill-Mas, Clemente-Casares, Pilar, Albiñana-Giménez, Néstor, Maluquer de Motes Porta, Carlos, Hundesa Gonfa, Ayalkibet, & Girones Llop, Rosina. (2005). Efectos sobre la salud de la contaminación de agua y alimentos por virus emergentes humanos.Revista Española de Salud Pública79(2), 253-269. Recuperado en 21 de junio de 2016, de http://scielo.isciii.es/scielo.php?          script=sci_arttext&pid=S1135-57272005000200012&lng=es&tlng=es.


miércoles, 28 de mayo de 2014

¿Qué es la parálisis del sueño?



La parálisis del sueño aislada es un trastorno del sueño sorprendentemente común que se produce durante la transición entre el sueño y la vigilia, ya sea en los momentos previos a conciliar el sueño o en el momento del despertar. Quien la sufre, despierta bruscamente teniendo plena consciencia de sus pensamientos pero manteniéndose paralizado físicamente. Como si del síndrome del enclaustramiento se tratara, la persona se siente atrapada en su propio cuerpo.

Aunque puede abrir los ojos, no es capaz de emitir sonido ni mover músculo alguno, lo cual le genera una considerable sensación de angustia y de temor por estar sufriendo un episodio de una enfermedad grave. Por si fuera poco, al encontrarse en un estado de limbo entre el sueño y la vigilia, la persona suele padecer alucinaciones auditivas y visuales que generalmente coinciden en una intensa sensación de presencia y de movimiento en torno a su cuerpo indolente.

Este trastorno se debe a una intrusión anormal de un estado de REM (movimiento ocular rápido) durante un estado de vigilia: literalmente estás despierto, pero parte de tu cerebro sigue sumido en el sueño. Durante la fase REM, el cerebro inhibe el movimiento de la mayoría de nuestros músculos para evitar que representemos los sueños y nos lesionemos de forma involuntaria, de ahí la parálisis corporal. Suele manifestarse en contadas ocasiones en individuos con plena salud mental pero sometidos a altos niveles de estrés, cansancio y jet lag, que alcanzan la fase profunda del sueño con demasiada rapidez (antes de las primeras dos horas) y que acostumbran a dormir boca arriba. Descansar lo suficiente a menudo resuelve el problema. Sólo aparece de forma periódica en pacientes de ansiedad, trastorno bipolar, depresión y trastorno de estrés postraumático.

Los ataques a menudo implican sensaciones de terror, ira y de muerte inminente, ya que las alucinaciones suelen ser de carácter siniestro y malévolo. Es recurrente la visión de un ser grotesco que se sienta sobre el pecho y oprime la respiración. No existe, sin embargo, riesgo para la vida en ningún sentido, ya que nada de lo que vemos y oímos (e incluso olemos) es real, y la parálisis cede a los pocos minutos, normalmente a causa de un vasto esfuerzo por incorporarse o del contacto con otra persona que acude alarmada. Una vez despiertos del todo, es aconsejable levantarse y moverse; de lo contrario existe la posibilidad de volver a experimentar un estado de parálisis del sueño.

Esta cruel disfunción cerebral ocurre desde tiempos inmemoriales y probablemente sea la explicación a muchas de las experiencias paranormales que buena parte de la población asegura haber sufrido tras el ocaso.

Tomado de: Muyinteresante.es